博洛带领大军攻陷青浦县城后，并没有直接攻向松江，而是选择了先消灭驻扎在柳湖的吴志葵和黄蜚部。
此时吴志葵和黄蜚还拥有战船五百多艘，其中不乏千料大船，士兵两万余人，但是士兵的装备极差，绝大部分士兵根本没有盔甲，很多人破衣烂衫手中拿的也只是刀枪这样的武器。松江府乃是天下有数的富裕之地，而明军士兵却非常贫穷，简直如叫花子一般，这不能不说是一种绝大的讽刺。
近四万清军达到柳湖附近，面对强大的八旗兵，吴志葵和黄蜚哪里敢主动迎战，只是在柳湖之中扎下营寨，坐等清军来攻。
而博洛也没有急着去攻打，而是四下征集了数千艘小船，然后以小船堵塞了柳湖两端的水道，使得盘踞在湖中的明军进退不得。
博洛下令绿营兵田雄张杰等人乘坐小船水陆两路，对柳湖中的明军发动疯狂的进攻。
田雄张杰俱都是原来靖国公黄得功的部下，长期驻扎在长江边，对水战并不陌生。而田雄的部下是绿营兵中战斗力较强者，投降了满清之后，经过满人的调教，绿营兵焕发出了远胜在明朝时的战斗力，因为只要大战畏缩不前，督战的八旗兵的屠刀就会降临到他们头上！
在绿营兵的疯狂攻击下，柳湖的明军大败，很快被杀得溃不成军，而两头的水道又被清军堵塞，使得他们逃都无处可逃。
战斗打了一天，明军的水寨被清兵很快攻破，吴志葵和黄蜚带兵撤退，却被大队的绿营兵围住，二人先后被擒。
两万多明军最后能逃出去的不到三千人，这批明军后来逃到了淀山湖，归于马良属下。
击溃了柳湖的明军之后，博洛下令杀掉敢于抵抗的明军俘虏，上万被俘的明军在柳湖被杀，鲜血染红了整个湖面，而明军的首领吴志葵和黄蜚二人也同时被杀。松江名士夏允彝是吴志葵部的监军，柳湖兵败后侥幸逃出，后来得知松江城也被攻破的消息之后，于绝望中投松江塘自尽。
击败了柳湖的明军之后，博洛令部分绿营兵伪装成吴志葵的部下，逃到松江方向，口称吴志葵战败逃回。松江城内的沈犹龙等人不妨有诈，下令打开城门，接应外面的明军入城。于是乎，清军顺势杀入城中。
城内预伏清军间谍，都伪装为黄蜚军士，到此大呼上城，拔去明军旗帜，换上清军旗帜，守军领时陷于混乱。清军一拥而入，就势夺占松江府城，城内义军和清兵展开激烈巷战。沈犹龙于慌乱中冲出，中箭身亡。
城内的士绅们大多被清军斩杀，部分人自尽。
几社名士、原兵科给事中陈子龙侥幸从西门逃出，和夏允彝的儿子夏完淳逃向尚在明军治下的吴淞城。
攻破了松江城之后，博洛又分兵打下了上海县。而闻知松江城破，上海县的明军早就弃城而去，逃向崇明去了。
占据了松江府一府三县之后。贝勒博洛留苏松提督吴胜兆带兵驻守松江府，剿灭尚且盘踞在金山卫的明军。自己则带领大军攻打吴淞口的崇明军去了。然而到达吴淞口之后，发现吴淞城的明军早已撤退而去，城内的一切搬去一空，就连吴淞城堡的城墙都被拆的七零八落。因为没有水军，不具备攻打崇明岛的实力，博洛只得领军离开了吴淞口，往江阴而却。因为此时整个江东四郡的抗清义军基本上都被扑灭，可是小小的江阴城却依然没有拿下。而清军已经在江阴城下折损了数万人。
任思齐之所以选择全面撤退，自然有他的考量。因为他觉得现在的崇明军还不具备和清军硬拼的实力。若是强行防守吴淞城，虽然也能消耗一部分清军的兵力，可是没有太大意义。杀敌一千自损八百，这样的事情对崇明来说没有多少好处。
现在对崇明来说，最重要的就是时间。只要再有数月的时间，又一批新兵将训练出来。只要崇明能够训练出五万精兵，并且装备上精良的武器，就有了和清军叫板的实力。若是能拥有十万大军，则可以图谋整个江南。而以崇明现在的发展势头，这一天不会太远！
可是并不是所有人都理解任思齐的想法，比如刚入崇明岛的陈子龙和夏完淳二人，就天天逼迫着任思齐出兵。
能得到陈子龙和夏完淳这样的名士，任思齐一开始是非常的兴奋的。越来越多的文人名士投到崇明，象征着崇明的蒸蒸日上。而据沈廷扬所说，陈子龙此人有大才。
陈子龙崇祯十年进士，从小就是天才人士，以文学名江南。他的诗歌成就较高，诗风或悲壮苍凉，充满民族气节；或伟丽秾艳，直追齐梁初唐；或合二种风格于一体，形成沉雄瑰丽的独特风貌，为云间诗派首席，被公认为明代最后一个大诗人。更关键的是此人并非在文学方面厉害，在其他方面成就也很不凡。在他的主持下，编撰了《皇明经世文编》一书，凡五百零四卷，又补遗四卷。是书选文以明治乱、存异同、详军事、重经济为原则，内容十分丰富，包括政治、军事、赋役、财经、农田、水利、学校文化、典章制度等等。而且，陈子龙整理了徐光启的农学巨著《农政全书》，可见此人乃是个全才。
更重要的是陈子龙的气节，在历史上，明朝灭亡之后，陈子龙一直不肯降清，先后数次拒绝了清军的招揽。然后剃发令起，陈子龙立刻和沈犹龙等人绸缪抗清之时，号召松江士绅百姓群起抗清，短时间内占据了松江一府三县。而历史上当松江被攻占之后，陈子龙先是隐居了一段时间，后来又应鲁监国相邀，出任鲁监国的兵部尚书一职。后来清苏松提督吴胜兆不满清兵的排挤，举兵反正，陈子龙为吴胜兆奔走联络，吴胜兆兵败之后，陈子龙化名逃亡，继续从事抗清事业。后被清军俘虏，宁死不降，跳入河中自尽。
对于这样的民族英雄，任思齐从来都是抱着很大的敬意。可是这些人也都自豪固执的很，自以为学识渊博，往往刚愎自用、目中无人，让任思齐颇为头疼。
所以在陈子龙刚到崇明时，任思齐热烈欢迎之后，任命他为沈廷扬的副手，主持崇明的农事。哪知道陈子龙真有大才，只是两日的功夫熟悉了崇明的情况，然后又用数日时间，把崇明的开荒屯田工作安排的井井有条。然后就听说了任思齐下令从吴淞城撤退的消息，立刻前来逼问。
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